医院现设有34个临床科室、11个医技科室和7个临床研究所（天津市神经病学研究所、天津市影像医学研究所、天津市肺癌研究所、天津市内 分泌研究所临床部、天津性传播疾病研究所、天津普通外科研究所、天津呼吸疾病研究所）。设有2个博士后流动站，临床医学为一级博士授权点，29个博士学位授权点，30个硕士学位授权点。有4个国家级重点学科（中西医结合临床、神经外科、内分泌与代谢病、泌尿外科（与二院共建））、4个国家“211工程”重点建设学科（中西医结合临床、神经外科与神经病学、影像医学与核医学、内分泌与代谢病）、6个天津市重点学科（神经外科与神经病学、影像医学与核医学、内分泌与代谢病、胸心外科、普通外科、内分泌与核医学）。